Nick Lane y Clarence Wing

A los que no les guste tragarse el rollo nostálgico y demás, que se vayan directos a la miga, que viene al final. Aunque el resto también tiene sustancia.

A la derecha, el simpatiquísimo doctor Nick Lane. El artículo no está en la wikipedia en castellano, y no pienso hacerlo XD... En este caso, por conflicto de intereses: traduje su primer libro al castellano y mantuve una cierta correspondencia con él y con su amabilísima esposa, la también investigadora española Ana Hidalgo. Pondría alguna foto más de Nick tomándose una cerveza con los amigos en un pub de Gales, pero claro, últimamente andamos en este blog en plan "noble experimento", también llamado "Ley de Volstead" XDD.

¿Qué puedo decir de Nick, a parte de que está en uno de los lugares más envidiables del mundo, en el que, además de estar a dos pasos del Natural History, si tienes enchufe puedes entrar en su club social, en el que el precio de la pinta de cerveza está tirado... -Ups, perdón, no me acordaba de que estamos bajo la ley Volstead- Nick reconoce en sus libros que "disfruta fumando", aunque tiene intención de dejarlo. Exactamente igual que yo.

En fin, Nick es para mi algo más que dios. Me adhiero completamente a sus planteamientos y trato de ir incluso más lejos. No tuve ningún problema por contactar con él cuando le comenté quien era mi tutor doctoral, Jaime Miquel Calatayud, quien lamentable poco después abandonó su trabajo por problemas de salud. No en vano, Nick menciona mi antiguo jefe en varias ocasiones. Mi antiguo jefe es, ni más ni menos que el autor de la teoría mitocondrial del envejecimiento, y aún continúa haciendo revisiones. A mi mujer y a mi nos encantaba que tuviera tantos gatos en su casa: el nos decía "es para recuperar karma, en california tuve que sacrificar muchos en mis experimentos".

Hacía mucho tiempo que no contactaba con Nick Lane. La última vez traté de visitarle en el Imperial College, -no por la cerveza barata- sino por otra tarea: gustavocarra firmó una vez como "clarence wing", y tenía que irme a este ala del hospital de St Mary a cancelar ritualmente esa etapa. Y fui.

--------

El caso es que me preguntaba qué demonios estaba haciendo el bueno de Nick, y mira tú: estaba entretenido en publicar un Nature... casi na...

Y no un nature cualquiera, no: Uno bestia donde los haya, un trabajo excepcional que emplearé a destajo cuando por fin pueda abordar la redacción de [[Mitocondria]]:

Lane N, Martin W. The energetics of genome complexity Nature. 2010 Oct 21;467(7318):929-34 PMID: 20962839. O sea, antes de ayer. Tres cosas:

• Obviamete lo voy a examinar con lupa e incluso hablaré con el propio autor para contaros en este blog de qué va el tema
• Francis: por favor, por favor, no me lo pises ¿quieres? :)
• ¿Sabéis quien es William Martin, el otro autor? Pues también es dios, más que dios, diría yo. En pocas palabras, el que con sus trabajos demostró a Lynn Margulis que no se puede ser tan Hippy.

Continuaré con este apasionante tema en otro post.

Todos estan cambiando/ 20 de abril...

So little time
Try to understand that I'm
Trying to make a move just to stay in the game
I try to stay awake and remember my name
But everybody's changing
And I don't feel the same

Si, a veces hay que aceptarlo, sobre todo si te vas haciendo viejo. Dedicado a un ángel muy viejo y con las alas enormes :)

Estoy harto

UNO: Harto de que algunos, cuyo estilo se parece sospechosamente al de Lucas y otros nicks, y que también se parece a anónimo, tenga como única estrategia cuestionar la competencia de los demás injuriando e insultando. Y sobre todo que sea la causa de que haya exacerbado esta estrategia en todo un grupo. Haciendo esto se está violando constantemente WP:NAP y dañando seriamente a los proyectos, y deberíamos ser inflexibles con respecto a esto. Tranquilamente podría decir lo mismo de la profunda ignorancia que muestran. Y ya se sabe que la ignorancia es atrevida.

DOS: ¿Cómo narices puede siquiera permitirse dudar de que yo no sé lo que es un potencial subumbral inhibitorio? ¿cómo puede dudar de que no conozco la estructura de la corteza cerebral, de cada núcleo o incluso de cada grupo celular? Lea por favor este artículo. ¿Cómo se permite siquiera dudar de mi competencia para distinguir entre inhibición de los impulsos y control de los impulsos después de escribir este artículo y sus anexos? ¿sería usted capaz de hacer algo igual?¿o este otro? ¿Entiende algo de plasticidad neuronal?

Me pregunto ¿lee de usted de verdad mis post? y lo peor... ¿Los comprende?

Y hago estas afirmaciones porque no hace mucho tiempo salté indignado porque alguien, un simple aficcionado a la mitología, se permitió, en una discusión, preguntarle a alguien si sabía algo de religiones. Pues bien: ese alguien es teólogo. Y el resto fueron jaleos e insinuaciones de incompetencia sin argumentación alguna. Y luego vinieron los ataques en grupo, los escarnios viñeteros, y los twitteos... O sea, una violación pura y dura de WP:NAP ante apartados que, según el texto de la política (léanselo y asimilenlo de una puta vez) son innegociables, y de paso, una violación de etiqueta y de conflicto de intereses.

Mire, vaya a paseo. No le tolero ningún comentario más bajo ningún disfraz. De la cara, pedazo de cobarde.

Mis recuerdos son míos

"No trates de que empiece otra vez
porque ya lo he superado, Ángeles,
podría satisfacerte en todo lo que haces,
todos tus "deseos secretos" se podrían hacer realidad
y quedarme para siempre abrazándote con mis brazos ponzoñosos
Nadie va a hacer escarnio de nosotros,
así que, encantado de haberte conocido, Ángeles"

Elliot Smith: Ángeles

Es curioso... Francis está hablando de la ruptura expontánea de la simetría en el grafeno... ya hemos anticipado aquí que posiblemente este ¿inesperado? premio Nobel podría obedecer a este cambio de paradigma científico-tecnológico-filosófico-artístico que tanto se barrunta.

Pero quiero traer aquí otro artículo analizado por Francis, sobre la expulsión de la pareja.

En mi caso, he tenido varias, y en su inmensa mayoría duraderas. Y a pesar de todo, siempre hablo en los mejores términos de ellas. Me parece una señal de respeto, de madurez y sobre todo, de respeto por uno mismo y de valoración por mis elecciones. Además de que realmente son fantásticas. Nada que ver con nostalgias obsesivas. Toda maledicencia contra tu antigua pareja es en realidad un mecanismo obvio, irreflexivo e irracional. Agradezco todo lo que me han dado, como la canción de Lluis Llach "Que tinguem sort". Y mis recuerdos son míos, porque yo los provoqué y porque son agradables.

De modo que si hablo de alguien en otros términos que no sean afectuosos y llenos de reconocimiento, es porque, sencillamente, nunca hemos sido pareja.

¿Me leen los grandes boggers de ciencia? (o como, en realidad, hay una gran crisis de paradigma)

Bueno... es curiosísimo ver cómo el 4º blog de divulgación científica y 54 del mundo repite mis argumentos casi punto por punto. Comprobar: [1][2]. También Francis se está preocupando de mis asuntos filosóficos con este descacharrante arXiv: [3].

A pesar de que tengo un tráfico tremendo para un blog humilde, y aunque no descarto que realmente me lean, prefiero asociarlo a que actualmente existe una gran tensión por el cambio brutal de paradigma científico que se viene acentuado en los dos últimos años. De ahí tanto cachondeíto, tanta percepción simultánea (que no sincronicidad) y demás.

Como dijo alguien a quien a pesar de todo quiero con toda mi alma: "todos los que estamos en ciencia avanzada somos capaces de captar los hotspots". Y, al menos en esto, tenía razón.

Es curioso que las crisis de paradigma suelan coincidir con crisis económicas. ¿Los recortes de presupuesto eliminan estudios "chorras"? No creo que sea tan fácil. Pensad en Atenas o en Florecia.

Seguiré en otro post con el estudio del señor Francis.

Una buena parte de Darwin es cierta

En este blog acabamos de hacer un par de afirmaciones escandalosas, a saber: Que no todas las mutaciones son igualmente probables, y que existe una "deuda de reversión" en los organismos a medida que se vuelven cada vez más complejos. Obviamente, todo esto entra dentro del terreno de la hipotesis, y debe ser demostrado posteriormente (idealmente mediante experimentación XDDD ).

No son fantasmagorías. Me baso en la interpretación de varios artículos y en mi propia experiencia:

1.- Moser CC, Page CC, Dutton PL. Darwin at the molecular scale: selection and variance in electron tunnelling proteins including cytochrome c oxidase. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2006 Aug 29;361(1472):1295-305. PMID:16873117 Ver especialmente la página 1303.

2.-M. V. Rockman, S. S. Skrovanek, L. Kruglyak. Selection at Linked Sites Shapes Heritable Phenotypic Variation in C. elegans. Science, 2010; 330 (6002): 372 DOI: 10.1126/science.1194208

3.-Wagner, GP et al: Pleiotropic scaling of gene effects and the 'cost of complexity Nature 452, 470-472 (27 Mazo 2008) PMID: 18368117 (se necesita suscripción).

Recomiendo su lectura detenida según los patrones del post anterior.

Porqué los alumnos interrumpen las explicaciones.

Me gusta que los alumnos participen en la clase. La biología, y las ciencias en general conllevan la asimilación de procedimientos específicos, y uno de ellos es la descripción de procesos. El que los alumnos anticipen el siguiente paso del proceso es un indicador de que se está construyendo un aprendizaje significativo.

Sin embargo he visto cómo tanto en las conversaciones con compañeros como en mi propia experiencia se percibe cómo los alumnos son cada año más incapaces de esperar a que organices el turno de palabra, lo que hace muy difícil aplicar esta técnica pedagógica.

Ahora un estudio nos muestra el porqué de esta conducta. Una de sus autores, el doctorando S.J. Hayton, del Centro de Neurociencias de Queens, nos cuenta parte de la motivación del artículo:

"En el aula, a los chicos frecuentemente se les escapan las respuestas antes de levantar la mano. Con el tiempo aprenden a sujetar su lengua y levantar la mano hasta que el profesor les da permiso. Queremos saber cómo tiene lugar este tipo de aprendizaje en el cerebro"

La referencia del estudio es: S. J. Hayton, M. Lovett-Barron, E. C. Dumont, M. C. Olmstead. Target-Specific Encoding of Response Inhibition: Increased Contribution of AMPA to NMDA Receptors at Excitatory Synapses in the Prefrontal Cortex. Journal of Neuroscience, 2010; 30 (34): 11493 DOI: 10.1523/JNEUROSCI.1550-10.2010.

La conclusión es que la supresión de la impulsividad, que es la base de esta conducta de los alumnos, es entrenable, y que el control de la impulsividad mediante entrenamiento afecta a los receptores AMPA y NMDA (implicados en la plasticidad neuronal) de la corteza prelímbica, pero no infralímbica ni amigdalina. Esto podría tener grandes repercusiones en el el diseño de tratamientos para las adicciones y algunos trastornos y enfermedades mentales, como el trastorno por déficit de atención con hiperactividad (TDAH) y la esquizofrenia.

Hemos dicho que hay que leerse los métodos de un artículo para juzgar o no si son fuentes fiables.

Veamos:

• Al inicio del experimento se emplean sólo ratas macho (N=108). Es un número muy habitual. La edad varía entre 35-46 días, es decir, poco antes del descenso testicular en los machos (dato que no aportan y que hay que suponer... digo yo).
• Aproximadamente la mitad son utilizados como controles y sacrificados, mientras que a el resto (n=53) se les somete a una intervención muy invasiva conocida como "retrograde tracing" (el artículo no está en la wikipedia en castellano, y no pienso hacerlo). Se trata de abrirles un agujero en el cráneo con instrumental odontológico bajo anestesia e inyectarles microesferas fluorescentes en las áreas cerebrales objeto de estudio.
• Posteriormente, y antes del entrenamiento, se les somete a tres días de privación de alimento
• Posteriormente se somete a las ratas a un protocolo de entrenamiento diseñado en parte en 2001 para ratones (no ratas) que comporta una inhibición de la respuesta.
• Hombre, el alojamiento era confortable: las ratitas vivían en cámaras de aislamiento sonoro, para que no se estresen y se centren en su tarea. Eso si, el ciclo diurno/nocturno estaba invertido, todos los experimentos tenían lugar en el ciclo nocturno.

A la vista de esta metodología ¿diría usted que este artículo es una fuente fiable?

Mmmm.... Ha contestado usted antes de levantar la mano y demasiado pronto. :)


La respuesta correcta es: depende de para qué. Hay experimentos que tienen una intención prospectiva, y en este sentido el experimento es robusto, bonito y muy sugerente. Se trata de abrir vías para posterior experimentación. La forma de citarlo sería precisamente así: "Ensayos llevados a cabo en ratas por el equipo de fulanito de tal sugieren que...". Para esta afirmación si que es una fuente fiable. Ahora bien, para hacer afirmaciones absolutas sobre el control de los impulsos en seres humanos, por ejemplo en los alumnos, pues obviamente no. Además, ya hemos dicho en este blog que la organización de la corteza cerebral en humanos y roedores es claramente diferente.

Y la segunda pregunta es ¿podrían haber llegado a esta conclusión leyendo tan sólo el abstract? Medítenlo un instante...

Querida Milagros:

Te mando esta carta desde el frente
A su recibo, devuélveme un aplauso y algún buen consejo
naciste con un compás, con un mapa en tu mesa
dime pues, cómo te diste cuenta de que tus derroteros eran erróneos.

Reza por nosotros, reza por que amaine la tormenta,
Porque en estos días fríos siento nostalgia por ti.

La ciudad no es lugar para perdedores,
Ah, pero jamás pensé que tuviera elección,
Estuvo claro desde el principio, clarísimo,
Yo sólo estaba ganando tiempo.

Necesitaba risas y amor,
Algún tipo especial de droga, necesitaba cigarrillos,
Tenemos asesinos tras nosotros,
El mal medra, envíanos protección.

Me ahoga esta ciudad,
esta trinchera construída por nosotros,
Y lo único que queda,
Si, lo único que queda es salir huyendo.

Y esos nubarrones siguen sobre nuestras cabezas,
e ignoro la razón,
Arrebátame esta guitarra de las manos,
porque me rindo.

Esta ciudad no quiere borrachos,
ni cantautores, ni mala poesía,
Quieren drogas, discotecas y risas,
Y nosotros no las tenemos.

Sólo reza por nosotros, reza porque amaine la tormenta,
Estos días son fríos y me entra nostalgia de ti.

Esta carta es sólo para ti,
Destrúyela y después ve a ocultarte,
Tú eres lo único que queda con sentido,
Por favor, no lo estropees.

La valentía de Brigitte Fontaine

Llevo unos días tremendos de insomnio, paliados por los encuentros (día si y día también) con mis antiguos alumnos en la universidad. El de ayer fue especialmente entrañable, en el que confié detalle por detalle mis proyectos a mi alumno más brillante de todos los tiempos. Es todo un placer. Estoy seguro de que no encontraré mejor ayudante cuando ponga en marcha la sondita de marrás.

Pero yo quería traer las letras incendiarias de Brigitte Fontaine. No hay artículo en la wikipedia en castellano y no lo pienso hacer. En "Comme Rimbaud" da un buen repaso a las imputaciones morales que se les hace los grandes genios y siempre llega a la misma conclusión: "puede ser que despues de todo, lo que pasa es que no te gusta la poesía, la literatura, la pintura ni la música, y además eres misógino".

"Me llamas falsa como Racine, exhibicionista como Rousseau, esclavista como Voltaire, inexistente como Shakespeare, pero puede ser, que lo único que pasa, después de todo es que no te gusta la literatura".

Suena casi a Joaquín Sabina. Y tal vez no sea por casualidad: Brigitte continúa cantando, exhibiendo esta vez su decadencia física sin el menor complejo, incendiando cada verso con una voz aún más frágil y terminal que la de Chavela Vargas.

Recomiendo: Prohibition.

Hoffmannsthal, la crisis y la filogenia profunda después de Bouguereau

Usted sabe que un arbol es un árbol
¿a qué más necesita dirigir su mirada?

Ronald Reagan

Una rosa es una rosa es una rosa

Gertrude Stein

Schlierenfotografie de una onda sonora.

John Lennon, in Memoriam. Feliz cumpleaños.

Estoy escuchando el disco de Omara Portuondo "gracias". Una maravilla que recomiendo a todo el mundo.

A la derechecha tenemos una imagen de una onda sonora tomada mediante una técnica conocida como "schlierenfotografie". Sus cualidades estéticas son innegables. Corresponde a la emisión de la vocal "a". La palabra "Schlieren" significa traza o raja. El procedimiento tiene muchos puntos de coincidencia con una técnica de microscopía llamada "contraste de fases", que permite observar muestras biológicas, que habitualmente son transparentes, sin necesidad de tinción.

La Schlierenfotografie comenzó a emplearse a mediados del siglo XIX. Uno de sus más curiosos partidarios fue el médico (biólogo) y filósofo Ernst Mach. Fue amigo, junto con Rilke, Richard Strauss y Wittgenstein. Desde la mecánica ondulatoria tuvo el arrojo de polemizar contra el Newtonismo, y muchos ven en Mach una de las influencias de Albert Einstein en su teoría de la relatividad.

En la carta de Lord Chandos (lo siento, no está en la wikipedia en castellano y no pienso hacer el artículo), Hoffmahnstal utiliza el género epistolar para dirigir a Francis Bacon un diálogo ficticio, en la que expone la tesis de la insuficiencia del lenguaje, y de que las palabras no corresponden con la realidad. Toda la filosofía del lenguaje que se generó posteriormente siempre tiene en cuenta esta preocupación.

Mi opinión es que tal vez, Hoffmannstahl estaba arto de tanto exceso verbal y tanta tontería. Y posiblemente la deconstrucción cierra este ciclo de la filosofía reivindicando la palabra como un hecho con entidad propia, como una realidad más. Y también como algo cumulativo que va abrazando la experiencia humana.

--------

Algo similar pasa con la biología y mi preocupación fundamental: La filogenia profunda.

Para ponernos en contexto, diré que el martes miércoles se cumplen dos años de un episodio que aún me afecta. Yo estaba en el cine Doré viendo un par de cortos de un autor neorrealista portugués, cuando, recogiendo una inspiración interior, comenté a otra persona que me acompañaba, también de biología: "al final todo se resume en la cuestión del origen de la vida". La contestación que recibí fue: "El origen de la vida son bobadas, yo prefiero hacer lo que me mandan".

En fin, estaba claro que no podía haber más distancia entre ambos aunque físicamente estuviéramos juntos. Me decepcionó horripilantemente, aunque posteriormente me quise hacer entender. Pero la lección que extraje es que, a veces, es mejor mantenerte en tu posición y ahorrar esfuerzos.
---------

Durante dos años antes de comenzar a escribir en wikipedia había estado elaborando una monografía sobre el papel del oxígeno en la evolución. Entonces no había hecho explícita mi tesis, tal vez porque nadie me había hecho la pregunta correcta. Poco después un gran amigo ingeniero me la formuló: ¿Crees en Darwin?

La pregunta tenía mucha miga, demasiada: el darwinismo sostiene que las mutaciones se producen "al azar", y que por tanto, fuera de la letalidad inicial, cabe la posibilidad, andando el tiempo, que se formen todas las combinaciones posibles, de las cuales la selección natural y la competencia se encargará de eliminar las que menos capacidad reproductiva tengan como resultado.

Ahora bien: ¿son todas las mutaciones igualmente probables?

-------

Estas dos digresiones vienen a cuento de que nuevamente he comenzado a hablar de la dicotomía estructura-función a mis alumnos. Y he visto que en esta dicotomía hay una insuficiencia del lenguaje. Hay que asumir que a la naturaleza le importa un comino el lenguaje, y que suele ser tozuda cuando intentamos encerrarla en cárceles verbales, en especial, cuando hacemos simplificaciones teóricas con fines más pedagógicos que científicos. Y siempre me queda el resquemor de estar deformando la capacidad crítica de mis alumnos con esos esquemas, aunque faciliten el estudio.

Mi idea de la filogenia profunda consiste en que, si observamos los rasgos más conservados de los sistemas biológicos, encontraremos las huellas del origen de la vida, lo mismo que George Smoot ve huellas de la dinámica del big bang en la propia lectura del universo: mirando lo muy grande, se ve lo muy pequeño.

Mi propuesta más radical, que tuve la suerte de discutir poco después del episodio del cine Doré con el propio Smoot (ver post alusivo en este mismo blog), es que huellas del big bang encontradas en de la estructura del universo y las huellas del origen de la vida encontradas en las estructuras observadas, obedecen a la misma razón: las propiedades cuánticas de la materia.

George Smoot y yo tratamos de mirar a dios a la cara, y por ello, enuncio mi principio:


Principio de convergencia de la filogenia profunda y las propiedades cuánticas de la materia: La diversidad biológica y las especies químicas que intervienen en la vida actual adquieren una "deuda de reversión" progresivamente mayor con respecto a su origen. En este origen los elementos biológicos estaban en el orden de tamaño en el que las propiedades cuánticas emergen. Por tanto, una explicación mecanística y evolutiva de la vida debe radicarse en el comportamiento cuántico de los elementos químicos.

---------

Esta idea está ganando terreno progresivamente, a medida que cobra importancia la investigación sobre nanomateriales. Tal vez por ello se ha concedido el premio nobel de física 2010 a los máximos expertos en el grafeno.

Otra de murciélagos guarrindongos

Gráfica original mostrando sexo explícito entre quirópteros. En la izquierda en rojo se muestra la duración de la cópula con cariñitos previos, y en la derecha, sin ellos. No la subo a wikipedia porque me la borraría Jimbo en cuestión de segundos, a pesar de que está disponible bajo licencia CC 2.5-by

Dios no Juega a los Dados

Albert Einstein

Dios es un ludópata

Belcebú

Que no, Igor, joder, qué no. ¡Qué
ludópata ni qué niño muerto! Lo que pasa es
que yo tiro los dados, y si no me sale lo
que quiero, los vuelvo a tirar.

Gustavocarra

Como se ve por las citas, el punto de vista del observador puede influir en las observaciones, razón por la cual la metodología científica es muy estricta a este respecto, y exige que todos los experimentos sean reproducibles por otros experimentadores. ¿Todos? No. La comunidad científica selecciona anualmente algunos cuya reproducción está muy desaconsejada.

Y precisamente es sobre reproducción de lo que va el siguiente artículo. Y es que no es la primera vez que traemos a este blog la manía que les está dando en PLoS One por los pobres murciélagos frugívoros. En un post anterior ya traté de cómo se ha demostrado científicamente que estos bichitos tienen una tolerancia alcoholica descomunal.

Ahora, y nuevamente gracias a PLoS One descubrimos otros secretos de la disoluta vida de estos especímenes. El paper se titula «Fellatio by Fruit Bats Prolongs Copulation Time», y ha conseguido el dudoso honor de ser considerado uno de los peores trabajos científicos de todos los tiempos.

En síntesis, se expone cómo la práctica de la irrumatio tiene el efecto de prolongar los tiempos coitales en varias especies de murciélagos, incluyendo al vampiro Desmodus robustus. En este experimento se emplea la especie asiática Cynopterus sphinx. Por si no se me ha entendido, diré que lo que se pretende es demostrar que la estimulación orogenital tiene como resultado una prolongación de los tiempos de acoplamiento en el acto de la cópula de los murciélagos chinos. El diseño experimental no tiene la menor dificultad: diríamos que está "chupado".

Nuevamente, el ethical statement es desternillante: lo han revisado entomólogos, que como todo el mundo sabe, es una rama de la zoología muy afín a los mamíferos.

El artículo se completa de jugosas descripciones, entre las que se encuentra cómo la hembra "humilla" (sic) la cabeza antes de proceder a la succión de las partes pudendas del macho. Va acompañado de vídeos. También se ofrece un recorrido por la etología comparada de esta práctica a lo largo de todo el reino animal.

La "conclusión final" es corta, pero intensa. Directamente la traslado, porque no tiene pérdida:

"En conclusión, hemos documentado que la felación en animales puede tener significación funcional. Por supuesto, los beneficios adaptativos siguen sin estar demostrados hasta que se testen, idealmente por experimentación, pero nuestro estudio identifica caminos potenciales para explorar si la hipótesis nula de que no existe beneficio (por ejemplo, por la vía del bajo costo para el donante y el recipiente) se debe rechazar. Creemos que el nuestro es el primer estudio observativo a gran escala del sexo oral en no humanos, y extendemosla interpretación de esta conducta más allá del "dar placer" dentro de un contexto evolutivo. De importancia resulta el que mostremosque la fellatio incrementa la duración de la cópula. Esto puede tener varias funciones importantes, por ejemplo el incremento del éxito reproductivo, o incluso reducir el riesgo de ETS. La conducta, presumiblemente, favorece al donante, aunque también podría beneficiar a ambos compañeros sexuales, especialmente si el éxito de fertilización se incrementa. Es concebible que la hembra manipula al macho incrementando su estimulación sexual, lo que en última instancia le beneficia."

-------

Varias cosas: PLoS es la publicación científica Open Source más famosa. Sus contenidos son compatibles con GFDL, por lo que se podría cortar y pegar en wikipedia citando la fuente. Existe un directorio de revistas de acceso abierto que ya pasa de las 5000.

Sus artículos suelen tener una elevada calidad e impacto. Al no contener publicidad ni otro tipo de medios de financiación, son los propios publicadores los que deben pagar una elevada cantidad de dinero por publicar. Cuantos más científicos publiquen, más ingresos. Eso lleva a que la mayoría de estas publicaciones relajen bastante la revisión por pares. Existe actualmente incluso una competencia y una guerra de precios, y te llegan a ofrecer paquetes de "publique cinco y pague cuatro".

PLoS Biology es una excepción: su revisión por pares es impecable.

----------

Conclusión ¿qué son fuentes fiables? Respuesta: al menos, en mi caso, me tomo la molestia de leer todo el artículo, sus materiales y métodos y su bloque de referencias para decidir si es fiable o no, incluso si se trata de Nature -o especialmente si se trata de Nature.

En última instancia, el asunto de las fuentes fiables es un problema de experiencia personal y de responsabilidad.

Lo digo porque he llegado a tener peleas y sinsabores con editores de wikipedia por mi escrupulosidad por la elección de las fuentes. Afortunadamente, ya pasaron hace tiempo.

Blog en servicios mínimos

Hola

Aviso

A partir de ahora, se moderarán los anónimos provisionalmente. Varios amigos me han rogado que este blog vuelva a ser el espacio de expresión personal y libre especulación que fue, y desde luego están por delante de todo.

Para hablar de asuntos de wikipedia, tengo otro blog, mucho menos visitado, ciertamente, pero es el lugar que desde el principio elegí para tratar sobre esos temas.

Mis errores y mis aciertos

A la derecha, Von Clausewitz: un matao.

Mi peor error, sin duda, pero de bulto, fue invitar a dodo a formar parte del capítulo. No puedo decir que no me lo advirtiera desde el principio: profecías autocumplidas. Forcé, incluso di la vara. Pero creía importantísimo para la salud del nuevo capítulo superar la época de acosos y contraacosos de la fundación del capítulo argentino. No en vano mi esposa es argentina. Creía que cada nuevo paso debía suponer un avance y una superación.

En especíal, quería dar por zanjada la abrupta y terrible forma en que dodo entró en contacto conmigo. Quería curar a la comunidad. Pero cada vez que quiero curar algo, la cago. Moraleja: no se puede forzar nada. Todo tiene su proceso.

Por eso, dodo, te lo has ganado: te pasaré tu diff en privado y por vía de un intermediario de confianza de ambos, para que no haya duda de que existe. Me asustó y me conmocionó. Sólo explico tu reacción por aquella época enloquecida.

---------

Mi segundo y gravísimo error, y hasta ahora pensé que el primero, ha sido mis planteamientos para sacar adelante la línea académica y educativa del capítulo. Ha sido una soberana catástrofe.

Advirtiendo desde el principio a las partes implicadas que yo soy una persona libre, y pensando que sabía navegar por esas procelosas aguas, traté de involucrar a dos personas que previamente habían tenido una implicación sentimental conmigo, una más y otra menos.

Mira que me lo dijeron: "no sé qué te traes entre manos". Imposible no ver segundas intenciones.

En principio, y en mi candidez, no vi inconveniente: somos personas adultas y civilizadas, y además ambas estaban comprometidas con el conocimiento libre y colaborativo, y ambas tenían estatus académico. Además de otras coincidencias.

Era juntar Mediawiki con Moodle, o sea: contenidos y procedimientos. Un plan genial. Obviamente, fue un completo desastre.

Niebla de guerra, que diría von Clausewitz. Lo que me pasa ahora, me lo merezco por ingenuo. Bastante suerte tengo: después de todo, siempre nos quedará una sauna.

--------

Mi gran acierto fue mis mandadas a la mierda: a los nacionalistas, a los excursionistas, a los legalistas... A día de hoy, no sé porqué no he seguido mandando a la mierda a más peña.

He de decir que en algunos casos lo comprendieron: te vas, descargas tu mierda y vuelves. Y todos envidiamos tu fantástica y rozagante cara de alivio. Joer... hay cosas que uno no puede quedarse dentro... Durante un tiempo tuve estreñimiento y sé lo que se siente. Lamentablemente, ahora es muy distinto.

---------

Y mi segundo acierto fue la junta directiva y quedarme fuera de ella... Sencillamente, les quiero. A todos.

Espero que no seáis uno patanes y veáis que ni remotamente os los merecéis. 30-0. Orgásmico. Uno de los mejores días de mi vida.

---------

Y luego me llaman cobarde...

Maravillado

De que Mariève haya vuelto a escribir. Este blog bebió durante mucho tiempo de su ejemplo e inspiración. Le debo sus mejores momentos.

Y espero sinceramente, para todos mis buenos lectores, que vuelva a ser lo que fue. Me ocuparé de ello.

Leyendas familiares

"Nunca voló la pluma mía por la región satírica,
bajeza que a infames premios y desgracias guía".

Miguel de Cervantes Saavedra, Viaje del Parnaso (IV, 103, vv. 34–36)

Sin querer vi la foto del amigo de Cruccone, un físico italiano que tuvo el detalle de estar presente en el encuentro fundacional de Wikimedia España. En esta fotografía, Ramsés Martínez utiliza un microscopio de sondas de fuerza atómica (AFM) para escribir a escala nanométrica el íncipit del Quijote.

Cervantes hace en su novela todo tipo de alusiones a personas de su entorno, y es conocido que el galeote Ginés de Pasamonte es una alusión a Jerónimo de Pasamonte, un personaje del círculo lopista madrileño, aragonés de nacimiento y probable autor del "Quijote de Avellaneda". Es conocida la ambivalencia de Cervantes por Lope.

La vida de Cervantes fue un tanto triste. Metido en follones con los lopistas (lope era bastante mafioso) fue el autor de su elogioso apelativo "fénix de los ingenios". Cervantes recibió acusaciones injustas y burlas infames por las heridas cobradas "en la mejor ocasión que vieron los tiempos". No es extraño por tanto que la mayor virtud del Quijote sea mostrar las inconsistencias y contradicciones de la existencia, rezumando en cada momento gran humanidad.

Mi pasaje favorito es sin duda la penitencia que hace don Quijote en Sierra Morena, y como se empeña en que Sancho presencie al menos media docena de disparates para dar cuenta de ello a Dulcinea. Y su insistencia en que las "calabazadas" sean auténticas. Enternece.

Se da por seguro que al menos en un primer momento su personaje estaba inspirado en Alonso Quijada Salazar, Tío abuelo de su esposa, Catalina de Palacios, aunque los críticos ven la síntesis de varias personas conocidas por Cervantes en la fábrica íntima del Hidalgo, sobre todo en la adopción del nombre definitivo. Entre ellos está el veedor de galeras gaditano Martín de Quijano, bajo cuyas órdenes estuvo Cervantes. En la última boda entre Carrancios y Quijanos este mismo verano (ala, a juntar las tierras, aunque sea la de los tiestos) tuvimos el gran placer de que nos visitaran dos simpatiquísimos y amenos representantes de la rama gaditana de nuestra familia, David y Javi, a los que saludo casi sin poder reprimir la risa por el recuerdo de sus ocurrencias.

Sin embargo existe en mi familia una leyenda según la cual, uno de los modelos vivos que inspiraron el personaje de Don Quijote sería el clérigo y beneficiario don Mariano de Quijano, del que soy descendiente más o menos directo. Esta hipótesis quedaría avalada por el hecho de que nuestra familia tiene en su posesión uno de los cuatrocientos primeros ejemplares del Quijote de 1605, ignoro si es el que tiene erratas, pero casi seguro, porque pude ver numerosas anotaciones de época en el volumen. También el hecho de que el personaje de Sancho fuera tal vez concebido en las andanzas de vecindario mientras se encontraba en Valladolid, inspirándose en Vaca de Castro. Es muy probable que en su residencia vallisoletane tuviera materiales humanos que aportar a su inmortal novela.

Así que ciertamente, Alonso Quijano "el bueno", y Gustavo Carrancio... Quijano, a mucha honra.

Ya queda menos

Ya queda menos para volver a mi tierra. A esa pequeña parte del mundo que ya no es un planeta, a mis orillas plutonianas. Este año es concurso nacional de traslados. Burgos, Zamora, Palencia tal vez... No oculto que mi ilusión es concursar en primer lugar por el monasterio de Santa María de Aguilar de Campoo. Podría elegir estar en una hora en Santander o en Palencia. Y me siento muy vinculado a ese lugar, porque mientras Jose María Peridis estaba llevando a cabo el proyecto de restauración, tuve el increíble privilegio de visitarlo mientras charlaba con Santiago Amón, en la edad de plata de la cultura palentina. Sería feliz.

Ya queda menos.

NADH:Ubiquinona deshidrogenasa

La imagen de la derecha ha sido preparada por mi a partir de los datos de la cristalografía de rayos x del complejo I de la cadena respiratoria de Thermus thermophilus. Es la primera vez en la historia que se consiguen los datos de cristalografía de este importantísimo complejo enzimático. Es, con toda probabilidad, el lugar donde más radicales libres se generan en la célula, en especial en anión superóxido, y por tanto un paso importantísimo para explicar el proceso de envejecimiento.


Lamentablemente no puedo emplearla en wikipedia, porque a pesar de no especificar licencia, Pymol inserta en la imagen un aviso de que debe ser utilizada para usos educativos.

La verdad es que lleva algo de trabajito, porque la imágen inicial es un dímero y hay que limpiar las subunidades duplicadas, así como los cluster de hierro.

Por lo demás, la cristalografía tiene una resolución aceptable, de 4 Å. Se debe desconfiar de las cristalografías porque las condiciones en cristalizan las proteínas son muy distintas a las que tienen en estado nativo y se pueden producir distorsiones importantes. Por ello se han realizado comparaciones con otros cristales y con programas de predicción de la estructura molecular de las proteínas.

Hay varias cuestiones que parece solucionar este modelo. En principio, parece ya claro que el electrón que induce los cambios conformacionales que translocan los protones en la subunidad intrínseca (la de abajo) es el segundo. Y que estos cambios se transmiten ¡mecánicamente! a través de las hélices horizontales de color turquesa a los tres centros "antiport-like" que componen esta subunidad. El cuarto electrón se "colaría" en la zona de unión entre la subunidad hidrofóbica e hidrofílica.


Por segunda vez aparece un mecanismo catalítico en el que se emplean máquinas moleculares en la cadena transportadora de electrones. El primer caso se produjo cuando estaba en mi último año de carrera, y se estableció que la ATPasa translocadora de protones funcionaba como una "turbina".

Ahora se ha visto con bastante claridad que el complejo I podría funcionar como los pistones de una "máquina de vapor".

El camino al destacado

Estoy muy concentrado en [[fosforilación oxidativa]]. Creo que en ciencias, debido a nuestro nivel de especialización, pero sobre todo, a condicionantes de nuestra comunidad, nos están colando auténticas inconsistencias. No hay que culpar a nadie, todo el mundo se deja llevar.

No estoy seguro de que la comunidad científica haya asimilado la importancia de las redes colaborativas y del conocimiento libre dentro de la producción científica. Y creo, sinceramente, que van a salto de mata. No creo que tengan un concepto de conocimiento enciclopédico formado, porque para nosotros es natural que todo esté muy disperso.

La gente se sorprendería de cómo científicos de élite, y propuestos al Nobel carecen de la noción de enciclopedismo, porque las nociones de sus campos y técnicas las han adquirido de las maneras más variadas y están encasillados en su manera de justificar a la sociedad su salario.

Con los ya Nobel tengo otras experiencias distintas: ya han llegado y pueden permitirse la creatividad.

Igor: ¿aceptarías que alguien escribiera en wikipedia que el principio de mano invisible está verificado experimentalmente por el paper del post anterior? Pues está en citation index con un impacto de la polla...

¿De qué narices estamos hablando cuando hablamos de fuentes fiables?

De un mundo mejor

Por cada uno que se levanta, hay otro que cae.
No hay nada a la vista que haga pensar en un mundo mejor.