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Cinco años de Don Quijote

Este blog, como su nombre indica, es el registro de un periplo personal, una bitácora.

Hace cinco años comencé una etapa diferente en mi vida, y me planteé llevar un registro. Precisamente porque se trata de un camino, todas las opiniones que vierto son provisionales, un intento de comprender y recapitular. También es un experimento literario. Algunas de las personas a las que me refiero son reales. Otras son en realidad una mezcla de referentes, de varias personas distintas que me permiten crear un arquetipo con el que dialogar. Es un poco como Pirandello y Unamuno.

Con ese velo puedo reconstruir mis momentos emocionales, aquello que me ha inspirado y preocupado durante estos cinco años y ponerlos en perspectiva. Creo que ha sido una experiencia muy bella, y la dejo aquí para disfrute de todos.

Hasta siempre.


sábado, noviembre 06, 2010

Carta a un degenerado



El video es una composición del artista armenio Arto Tunçboyaciyan junto con Omar Faruk. Repite en armenio: Սեր (amor), respeto y Ճշմարտություն (verdad) como los grandes valores armenios. San Bartolomé perdió su piel por la verdad.



Querido amigo degenerado:

Dodo, que no me refiero a ti, coño. Eso si, lo único que te reprocho es el que me hayas usurpado el derecho de echar filípicas a los amigos. Y es un derecho porque fundamentalmente les dices que les quieres cuando les dices que se han equivocado. Y ellos son los únicos que realmente te entienden. Tu no me entiendes: Amor, respeto y verdad.

En fin... vayamos con la filípica.

Degenerado viene de gens, de la misma raiz que gente. En fin, mi gens es la gente, el género humano.

Me he retenido durante meses de mandarte un correo con aquellas durísimas palabras del apocalipsis:

"15.Yo conozco tus obras, que ni eres frío, ni caliente. ¡Ojalá fueses frío, ó caliente!
16.Mas porque eres tibio, y no frío ni caliente, te vomitaré de mi boca
."


Y me he retenido por varias razones: la primera porque está fatalmente traducido: (Qué bien traducía pepe el griego, el muy puñetero) en realidad dice "estoy a punto de expulsarte de mi boca". O sea, que para que tenga sentido decirtelo, me tengo que retener un ratito. Un femtosegundo, concretamente. La segunda es que las iglesias orientales retienen mucho mejor el significado original de los textos canónicos.

Este es un mensaje en clave a la iglesia de Laodicea. La ciudad se llamó primeramente "ciudad de dios" (diospolis) y luego, el pueblo del juicio (laos). Es curioso porque la palabra Laodicea (también su versión pronunciada en argentino, la odisea) me ha venido extrañamente a la cabeza una y otra vez estos días.

El caso es que este año tengo cuatro horitas de alternativa a la religión, las cuales me vienen muy bien para revisar mis papers mientras mis alumnos me hacen la tarea. Pero a raiz de lo de Wilberforce y que "Amazig Grace" se esté presentando a destacado, se me ocurrió hacerle una proposición desonesta a la profesora de religión: Unir a ambos grupos para ver la película.

Increíblemente, y sin que viniera al caso, la profesora de religión me preguntó: "Oye, Gustavo, ¿tu que sabes del concilio de Laodicea?". ¿Sincronicidad? Pues todavía no habéis leído nada.

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Vamos a repasar un poco de patrística: Hablemos de Eusebio de Emesa, un tipo extrañísimo. Tenía una enorme reputación, hasta el punto de que le ofrecieron el patriarcado de Alejandría, y renunció. El problema es que luego la lió: sabía de tantos campos, reunía tanto conocimiento, que los de siempre se le echaron encima, y tuvo que huir con un amigo, Jorge de Laodicea, quien si aceptó el patriarcado posteriormente. Jorge, que es el santo patrón de Inglaterra, no pudo asistir al concilio de Laodicea porque murió exactamente un año antes. Pero la movida de Laodicea, el arrianismo y los semiarrianos son una historia apasionante. Tanto, que seguramente marcó la juventud de Hipatia de Alejandría.

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En fin, ayer falleció alguien muy, muy importante para mi. Después de una reunión, me fui destrozado a casa, y traté de sacar tabaco. No encontré suficiente dinero en mi cartera y el cajero más próximo estaba fuera de servicio. El más lejano estaba mucho más lejos de lo que mi ánimo me permitía caminar. Entonces, una persona con acento extraño vio mis ojos húmedos y me ofreció dos cigarros (sin pedírselos). Me invitó a sentarme y charlar, y al menos, para dos cafés si tenía dinero suficiente para compensarle sus dos cigarros.

Le pregunté de donde era, y me dijo: soy armenio. Le respondí que era un gran honor para mi, primero, porque era el primer armenio que conocía en mi vida, y segundo, porque es conocida mi devoción por San Bartolomé, patrono de Armenia, tan ligada a mi infancia, de la que ya hemos hablado en este blog.

Tuvimos una larga conversación en la que salió el tema de la iglesia de Laodicea, el problema de Juliano el apóstata. Justamente en Armenia se daba el mismo problema: El rey Arsaces II estaba intentando descristianizar Armenia y volverla al zoroastrismo.

En fin, el tipo sabía muchísimo de teología. También hablamos de porqué había tantas iglesias de estilo armenio en francia.

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La labor del sacerdote, me dijo al final, es unir al pueblo en la verdad. Lucifer, la luz (un concepto armenio ligado a cierto fondo zoroastrista) es el que trata de separar al pueblo. Cuando el sacerdote está unido a dios en el sancta sanctorum y pronuncia su nombre, se hace el pueblo y perdona (expía) los pecados, redime al pueblo: Laodicea, el juicio del Laos.

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No podemos separar al gens. Aunque nadie entienda, y aunque se despelleje a San Bartholomé y a Hipatia por la verdad. ¿Sabes? La pieza clave entre la iglesia de Laodicea e Hipatia de Alejandría está en la figura del experto en el canon Eusebio de Emesa, quien se libró de ser despellejado por ser amigo de San Jorge.

Los únicos sermones e Eusebio de Emesa que se conservan y que hablan de todo esto están en Armenia.

Sabes: Yo he tenido acceso y lo sigo teniendo a "http://es.wikipedia.org/wiki/Patrologia_Graeca". La culpa es de mi antiguo profesor de patrística, Jorge OSA. Nos llevábamos fatal, pero fatal fatal.

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En fin, amigo: Amor, Respeto y Verdad. Y a unir a la gente. Pero esa es vuestra tarea, yo ya estoy en el asilo.

viernes, noviembre 05, 2010

Amazing Grace

"Debemos ablandar los corazones duros
y curar los rotos".
John Newton




Hoy he estado realmente deprimido y falto de fuerzas. Supongo que todo lo que llevo viviendo estos últimos años se me ha acumulado. Supongo que el detonante fue cuando ya han anunciado que llega el concurso de translados. Supongo que algo ha tenido que ver cuando dada mi reputación, mis alumnos me preguntan que hago en un instituto de secundaria. Es curioso: cuando la profesora de química les preguntó que si conocían algún científico, todos dijeron que si: que a mi.

Supongo que entonces les dije que el año que viene me iba, y les enseñé las fotos del instituto en el que quiero retirarme: un monasterio medieval restaurado como instituto de secundaria. Y supongo que tiene que ver con que Mario me pusiera una cara triste y me dijera que me va a echar de menos.

Supongo que tiene que ver con las conversaciones con Fer, con Sergio, con el capitán de artillería, con Lorena y con Claire. Pero sobre todo, con las conversaciones con Juan de la Cruz, mi guía y mi luz en esta terrible y crónica noche oscura del alma.

Ablandar corazones duros y curar los rotos es mi trabajo. Me pagan por ello, así que no tengo escusas. Aunque el mío esté roto en mil pedazos, por la enfermedad de mi mujer, por lo lejos que está mi familia, por lo fracasado que me siento y las putadas que me han hecho en wikipedia... Por tantas cosas, y por lo viejo que me he hecho. Hay días que estás tan mal y tan roto... Y de repente viene Sergio y te levanta un poco el ánimo. Lo justo para el día siguiente. Sin contar a cierto valenciano al que quiero con todo mi corazón y que me llama todos los días.

No soy creyente, pero:

"La tierra pronto se disolverá como la nieve,
el sol cesará de brillar;
Pero dios, quien me llamó aquí abajo,
será mío para siempre".

Por cierto, Igor, Lucas, anónimo, sacacristos o como te llames, el tetragrámaton no significa "yo soy el que soy", sino "mi esencia es mostrarme a mi mismo", que aunque muy perifrástica, se acerca mucho más a su significado, debido a que poner nombre y comprender la esencia son lo mismo en la tradición bíblica. El artículo no está en la wikipedia en hebreo, y obviamente no pienso hacerlo, jejeje.

En este sentido interpreto las últimas estrofas de Amazing Grace. Y por tanto, debo hacer lo que debo hacer, aunque me parta el corazón en mil pedazos, y no sufra más que perjuicios, prejuicios e incomprensión. Sólo así dios será mío para siempre.

jueves, noviembre 04, 2010

Partamos del supuesto de una vaca de radio= "r"


Estoy muy agotado. Hoy he estado a punto de hablar del principio de idealización en ciencia a mis alumnos. Hay personas, como mi compañero de proyecto, que tienen un sentido innato de la didáctica. Si les hablara de Galileo y su esfera perfecta en un plano perfecto, bostezarían de inmediato y se olvidarían inmediatamente del tema.

En pocas palabras, a mis alumnos les he explicado: el método científico es falso por imposiciones sociales. Veréis: primero tenéis que hacer una hipótesis plausible. Plausible significa no sólo que esté en consistencia con el "conocimiento" actual, sino con su estructura social, que básicamente es competitivo. Luego tienes que realizar un proyecto en el que convences a un tio de servicios generales de que te debe dejar usar por un tiempo limitado un cacharrito muy caro, pero que muy muy caro, y que sabes a que parte del universo mirar (ya sea con un telescopio, un microscopio o con una pila de encuestadores. Por fin, obtienes un montón de datos que has tomado intentando evitar todo tipo de sesgos, y algunos de ellos son inevitables (por ejemplo, por la precisión de tu aparato).

Bien, una vez obtenidos los datos, elaboras un modelo. Pero la naturaleza es muy tozuda, y casi ninguno de esos datos se ajustan exactamente a tu modelo una vez excluidos los intervalos de "confianza" (debidos al error de precisión y aleatorio). Por ello, y para no estar paralizado, idealizas, aplastas los datos conforme a algo más controlable por la matemática en vigor, en la confianza de que futuras generaciones inventen máquinas más precisas, matemáticas más complejas, o bien simplemente modelos más exactos. La idealización es un acto de confianza en el futuro.

Básica y jocosamente, mi compañero de investigación resume este terrible fastidio de asumir tu insuficiencia y que en un momento debes de parar en la siguiente frase:

Asumamos una vaca de radio=r


Seguro que mis alumnos se olvidaran de Galileo, pero jamás de la imagen de una vaca esférica. Eso es calidad pedagógica.

Por cierto, desde hace dos años estamos de acuerdo en que wikipedia tiene gravísmos problemas que no son solventables por ceguera de la comunidad. A lo mejor es que no asumen la complejidad. A lo mejor es que ven una vaca de radio=r

Yo, fundamentalmente, quiero dos cosas:

A) Que la gente sepa que debemos cambiar. Cuando estemos preparados, sin presiones, sin fechas, sin acusaciones, sin malos rollos, pero que debemos cambiar. Eso es el 30% de lo que no me gusta de wikipedia.

B) Que soy increíblemente feliz investigando. La gente me ve distinta cuando manejo datos, encajo piezas, escruto bibliografía... soy muy feliz, es lo que soy, me ven otra cara y les encanta llamarme y estar conmigo. Y cuando estoy en esa situación, expreso mi felicidad, soy como un niño. Quiero que me dejen ser así. No ocupo mucho espacio de wikipedia: sólo un rinconcito. Y no me gusta cuando me reprochan que esa es mi forma de presencia en wikipedia. Eso es el 70% de lo que no me gusta en wikipedia.

Es fácil: asumamos una vaca de radio=r

martes, noviembre 02, 2010

Wikiberzosa (futuro papa)

A ver... Ratzinger no da para más, se jubila a los 80 (abdica, lo cual es probable) o la guiña. Por tanto, tenemos que sugerir al espíritu santo que de debe hacer desde el café de wikipedia. Mi futuro candidato no ofrece dudas: fue mi profesor de teología de la vocación. Para superar la asignatura nos ofreció dos posibilidades: o un trabajo, o examen. Obviamente, fui el único que elegí examen. Mientras con mal gesto me examinaba, tenía un notebook al lado. Todos sabíamos que acabaría de obispo, y aún hoy en día aparece públicamente con un portátil al lado, o sea: es un geek.

El próximo papa debe de ser un geek si el espíritu santo sabe de lo que se trata, y creo que tengo alguna confianza en que esto sea posible. O sea, que queda poco para que Berzosa sea papa.

Todos hacemos nuestras quinielas XDDDD


A la derecha, wikiberzosa gobernando wikipedia a golpe de encíclica XDDDD

wikinomics

Intentando estructurar que voy a contar en el congreso, aparte de lo de pathology informatics curriculum wiki, me encuentro con un viejo proyecto en biología molecular y celular. No sé que tal andará por allá, pero si quiero que en la wiki en español algo extraordinariamente complejo funcione colaborativamente, lo llevo claro.

Las prohibitinas forman parte de los nucleoides, estructuran la membrana mitocondrial en compartimentos, pero quedan muchos puntos oscuros, porque los ensayos son contradictorios... Por ejemplo, he intentado encontrar si los promotores de expresión de las dos prohibitinas me daban una pista... pues salvo uno, en realidad no termino de entenderlo. Todos son factores que controlan la proliferación, entre ellos el famosísimo p53. Hay muchísimos más detalles que me ahorro.

Recuerdo haberme enfrentado a este problema antes, y la solución venía de algo que se demostró muy posteriormente.

Sinceramente, opino que ambas cosas, lo de mi tesina y lo de los problemas con las prohibitinas está total y completamente conectado... Veamos: que pasa si los tubos de prohibitinas no se forman: que se escapa citocromo c hacia donde no debe...

Estoy intrigado y confundido. Otro ejemplo.

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Actualización: exacto, estoy viendo que los datos contradictorios tienen que ver con una vía de rescate, o sea, que la función estructural se puede rescatar con mi vieja amiga la cardiolipina...


"A CL deficiency in the inner membrane impairs the activity of mitochondrial enzymes (Jiang et al., 2000), decreases the stability of respiratory chain supercomplexes and of mitochondrial DNA (Pfeiffer et al., 2003), and accelerates apoptosis by facilitating the release of cytochrome c from the intramitochondrial storage compartments (Choi et al., 2007). It is conceivable that the assembly of the F1FO ATP-synthase and respiratory complexes is yet another process dependent on defined functional domains within mitochondrial membranes. This is suggested by the synthetic interaction of prohibitins with genes coding for assembly factors of inner membrane complexes (Osman et al., 2007), which do not drastically affect mitochondrial PE or CL levels when deleted.



Blanco y en botella... :)

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Ah... ¿que no se entiende? Veamos: estoy casi seguro de que los complejos respiratorios se encuentran casi exclusivamente en las crestas -o túbulos- mitocondriales. Ahora bien, la distancia entre ambas membranas mitocondriales es pequeñísima -entre 45 y 75 angstroms, este dato me llevó tres días encontrarlo- Los espacios sin crestas son amplios y forman túneles en los que la membrana interna y externa deben contactar. ¿cómo hacerlo? despejando ambos lados de proteínas, o sea, creando microdominios resistentes a detergentes, cosa en lo que la familia de las prohibitinas, la SPFH es una auténtica especialista. Hombre, he intentado ver si hay algo por ahí en las caveolas de los cilios, puesto que esta familia también está implicada en la mecanosensación, pero no he encontrado nada.

Este último detalle puede tener bastante miga.

domingo, octubre 31, 2010

¿Cuántos cuartos de baño caben en Mónaco?


Hay gente que exagera un poco con el dato. Recomiendo este hilarante comentario de Juan José Millas. Pero como Nick, suelo sugerir más de lo que digo. Nick fue el tipo que mandó a la porra la inconsistente y tan de moda "Hipótesis Gaia". La tesis fundamental era que el oxígeno está sometido a isostasia por la propia biosfera, debido al crecimiento vegetal y a la combustibilidad. Pero ¿dónde estaban los experimentos que lo probaban? Pues existían. Finalmente Nick los encontró, y fueron realizados por un doctorando del autor de la teoría de la hipótesis Gaia, James Lovelock. La metodología de los experimentos era un desastre. Conclusión: ¿Una tesis doctoral es una fuente fiable?

Cuando entré en electroquímica me enseñaron un cacharrete como el de la derecha, solo que más moderno y más guay. Se llama microscopio electroquímico de sondas. El artículo no está en la wikipedia en español y no pienso hacerlo. Es como un microscopio de fuerza atómica, pero con una sonda capaz de medir diferencias de potencial ínfimas. Me preguntaron ¿puedes hacer algo con esto?

Bueno, me pongo a revisar la bibliografía y resultó de lo más desalentador: Sólo había un artículo en el que se demostraba que determinados cambios transitorios en el potencial de membrana mitocondrial cambiaba la configuración de su ADN.

Mira tu por donde... Veamos, nick: ¿cuantos cuartos de baño caben en Mónaco? Digámoslo de otro modo:

  • Siete de las 13 proteínas que codifica el ADN mitocondrial son para el complejo I, nuestra famosa NADH deshidrogenasa (complejo I). Asumimos una única copia del gen por cada cromosoma, y una media de cinco-siete por nucleoide. El número de nucleoides por mitocondria puede pasar de 800, por lo que muchos autores hablan de un número de cromosomas de entre 1000-10000 por mitocondria. El tamaño de un nucleoide es de 68 nanómetros
  • El tamaño de un complejo I es de 18 nm, pero como está "obligado" a juntarse con al menos dos compejos III y algunas otras cosas, el ensamblaje que hace que un complejo I sea operativo es de un tamaño comparable al de un nucleoide.


Mmmmm la pregunta es sencilla ¿existe el mismo número de nucleosomas que de complejos I activos? NO HAY RESPUESTA. Lo que si que se sabe es que el número de nucleosomas está muy relacionado con una subunidad de la ADN polimerasa mitocondrial.

Y no la hay por varias razones: uno, casi todos los datos están mal en casi todo lo que se refiere a la mitocondria. Y se admite generalmente en la literatura especializada sin el menor empacho. Ya ves tú de lo que hablamos cuando hablamos de fuentes fiables. Por ejemplo: eso de que entre el 1-4% del oxígeno consumido se convierte en radicales libres es totalmente falso. Sólo para empezar.

El problema es que hasta ahora no se tenía forma de comprobar esos potenciales sin inyectar a la mitocondria reactivos... Hasta ahora.

Ahora se puede: hacer EPR, comprobar la topología general, los cambios de potencial, identificar proteínas claves, y además de una manera no invasiva.

El sistema OXPHOS depende de casi todo: de la morfología mitocondrial, de modificaciones postraduccionales, de sirtuínas, del citoesqueleto de actina, del metabolismo global, del catálogo de IKEA.

Pero voy a intentar poder con ello. Lo prometo :)

Wikipedia en el currículo

El año pasado, gracias a que tenía muchos medios, utilicé exaustivamente wikipedia para las clases de la asignatura "Ciencias para el mundo contemporáneo".

Del inicio de esta experiencia y de mis reflexiones previas da cuenta este post en mi otro blog.

Tal vez la mayor ventaja de wikipedia consiste en su capacidad de estar actualizada al momento. En ciencias para el mundo contemporáneo buscamos aportar conocimientos básicos sobre los distintos campos de la ciencia y la tecnología como parte importante del bagage cultural que todo estudiante de bachillerato debe llevar. Por su propia naturaleza, la ciencia cambia casi dia a dia, y por tanto se me ocurrió que era importante utilizar wikipedia como el medio más idóneo para percibir ese cambio.

Existe una abundante literatura sobre las reacciones del mundo académico y wikipedia, pero muy poca sobre su uso en las enseñanzas secundarias. Realmente yo tengo mi propia opinión, pero lo que más me interesa es la percepción de mis compañeros con respecto a esta herramienta. Hay que darle muchas vueltas a la cabeza.